Ученые Курчатовского геномного центра и Томского государственного университета (ТГУ) разработали расчетную систему для оценки племенной ценности свиней.
— Одна из больших проблем современного свиноводства — рождение поросят с генетическими дефектами. Такие животные медленно развиваются, имеют низкий вес, позже достигают зрелости и неэффективны с точки зрения воспроизводства и прибыльности для мясной промышленности, — рассказывает Елизавета Мишина, и.о. заведующей лабораторией геномных технологий сельскохозяйственных животных НИЦ "Курчатовский институт". — В ходе исследований наша научная группа должна выявить факторы, которые влияют на рождение поросят с генетическими дефектами. И оптимизировать селекционный процесс, включив эти факторы наряду с показателями продуктивности в общую индексную оценку и определив собственный генетический потенциал животного независимо от условий его содержания и влияния внешней среды.
Ученые проводят общий GWAS-анализ (genome-wide association studies) животных с целью определить комплексную разницу в геноме животных, у которых в опоросах встречаются и не встречаются поросята с генетическими дефектами. Биологи оценивают, какие биохимические процессы привели к таким нарушениям, с какими именно генами они могут быть связаны.
После того как будут определены хорошо подтверждаемые маркеры, ассоциированные с конкретными дефектами, по ним можно будет проверять всех животных. Генетические данные из Курчатовского геномного центра поступают в Передовую инженерную школу "Агробиотек" ТГУ, где на основе математического метода будет разработан алгоритм определения племенной ценности животных.
— Окончательно определившись с общей формулой индексной оценки, состоящей из оценок племенной ценности по различным признакам, мы сможем автоматизировать нашу систему. Селекционеры получат возможность самостоятельно собирать фенотипические данные, генотипировать животных и загружать полученные данные в систему. Она автоматически проведет проверку на дефекты по маркерам и выдаст оценку племенной ценности, на основании которой специалисты свиноводческих хозяйств смогут принимать селекционные решения. Это позволит постоянно контролировать и улучшать продуктивность стада, — поясняет Елизавета Мишина.
